La industria de la acuicultura dedica grandes esfuerzos a controlar la incidencia de las enfermedades infecciosas a través de medidas de higiene y bioseguridad, mejora genética para obtener líneas de peces más resistentes, vacunaciones, y monitorización y diagnóstico para detectar peces enfermos y en su caso aplicar tratamientos o proceder al sacrificio en caso de animales irrecuperables, ausencia de tratamientos o para evitar la transmisión descontrolada de la enfermedad.

Es destacable también el hecho de que el número de medicamentos para acuicultura autorizados en la UE, 304, es muy bajo en comparación con los autorizados para otros tipos de ganadería. Además, más de la mitad son vacunas. De estos 304 medicamentos, en España solamente están aprobados 26, siendo 17 de ellos vacunas.